牙菌斑是牙周病的元凶，在除去之后还会不断地在牙面重新形成。菌斑清除不到位，加上唾液中的矿物盐逐渐沉积，日久天长就会形成牙石。而牙石的存在使得菌斑与组织表面紧密接触，引起牙周组织的炎症反应。此外，牙石的多孔结构也容易吸收大量的细菌毒素，并且牙石还会妨碍刷牙。长时间不清除，可能引起牙龈炎、牙周炎、出现牙龈出血、口臭，最终引起牙齿松动，甚至脱落等现象。牙石形成后无法通过刷牙去除。根据牙石沉积的部位不同，以牙龈的边缘为界可以分为龈上牙石和龈下牙石，顾名思义，洗牙主要负责清除龈上牙石，但实际操作中还应将牙龈沟内与龈上牙石相连的浅的龈下牙石一并清除。

由于食用一些食物和有色饮料等，牙齿上还会堆积一些色素。在龈上洁治的过程中，这些色素也会被去除。但由于牙齿表面并不像镜面一样光滑平整，所以要将色素完全清除是无法做到的，总会有一些色素残存在牙齿表面凹陷的地方。洁治完成后，需要用橡皮杯和抛光膏将牙齿表面打磨光滑，从而减缓菌斑的附着和牙石的形成。

洗牙的主要目的是为了防治口腔疾病，而不单纯是为了好看。通过洗牙可以减轻牙龈炎、牙周炎的炎症状况，但单靠洗牙是不能治愈牙周炎的，还应该在洗牙之后进行进一步的专业治疗。